Для производственного (production) применения рекомендуется Debian Way!
Общая логика работы в Redmine примерно такова:
Пользователь открывает в браузере адрес сервера -> запрос обрабатывает Apache -> передает в Passenger -> вызывает Ruby-проект Redmine -> Далее Ruby-Redmine работает с базой и файлами.